＜通勤手当の非課税限度額の改正について＞

　令和７年11月19日に所得税法施行令の一部を改正する政令が公布され、通勤のため自動車などの交通用具を使用している給与所得者に支給する通勤手当の非課税限度額が引き上げられました。

　この改正は、令和７年11月20日に施行され、令和７年４月１日以後に支払われるべき通勤手当（同日前に支払われるべき通勤手当の差額として追加支給するものを除きます。）について適用されます。

　このため、改正前に、改正前の非課税限度額を超えた通勤手当を支払っていた場合には、令和７年分の年末調整で対応が必要となることがあります。

改正後の１か月当たりの非課税限度額は、次のとおりです。

※国税庁参照URL

https://www.nta.go.jp/users/gensen/2025tsukin/index.htm

改正後の非課税限度額は、令和７年４月１日以後に支払われるべき通勤手当について適用されます。

なお、次に掲げる通勤手当については、改正後の非課税限度額は適用されません。

⑴ 令和７年３月31日以前に支払われた通勤手当

⑵ 令和７年３月31日以前に支払われるべき通勤手当で同年４月１日以後に支払われるもの

⑶ ⑴又は⑵の通勤手当の差額として追加支給されるもの

　では、課税済みの通勤手当についての精算はどのように処理するのか。これについては、下記の流れに沿って行うこととなります。

⑴ 改正前に既に支払われた通勤手当については、改正前の非課税限度額を適用したところで所得税及び復興特別所得税の源泉徴収が行われているが、改正後の非課税限度額を適用した場合に過納となる税額がある場合には、本年の年末調整の際に精算することになります。

(注)１ 既に支払われた通勤手当が改正前の非課税限度額以下である人については、この精算の手続は不要です。

２ 年の中途に退職した人など本年の年末調整の際に精算する機会のない人については、確定申告により精算することになります。

⑵ 年末調整の際における精算の具体的な手続は、次のように行います。

イ 既に改正前の非課税限度額を適用したところで所得税及び復興特別所得税の源泉徴収をした（課税された）通勤手当のうち、改正後の非課税限度額によって新たに非課税となった部分の金額を計算します。

ロ 「令和７年分給与所得に対する源泉徴収簿」（以下「源泉徴収簿」という。）の余白に「非課税となる通勤手当」と表示して、イの計算根拠及び今回の改正により新たに非課税となった部分の金額を記入します。

ハ また、源泉徴収簿の「年末調整」欄の「給料・手当等①」欄には、「給料・手当等」欄の「総支給金額」の「計①」欄の金額からロの新たに非課税となった部分の金額を差し引いた後の金額を記入します。

ニ 以上により、改正後の非課税限度額によって新たに非課税となった部分の金額が、本年の給与総額から一括して差し引かれることになるため、その差引後の給与の総額を基にして年末調整を行います。

　そして、給与所得の源泉徴収票の「支払金額」欄には、非課税とされる部分の通勤手当の金額を除いた金額を記入します。

(注) 年の中途に退職した人などに対し、既に給与所得の源泉徴収票を交付している場合には、「支払金額」欄を訂正するとともに、「摘要」欄に「再交付」と表示した給与所得の源泉徴収票を作成し、再度交付します。

以上の流れを元にした年末調整で精算する際の源泉徴収簿の記載例について

は、以下のとおりとなります。

※国税庁参照URL

https://www.nta.go.jp/users/gensen/2025tsukin/pdf/02.pdf

　これから年末調整業務がピークを迎えるかと思われる。本年は基礎控除等の見直しにより年末調整業務が例年になく大変になる中で、本件、通勤手当の非課税限度額の改正についても十分留意してください。